The Structure and Energy of D-Sorbitol from an Empirical force-Field 


Vol. 29,  No. 2, pp. 104-110, Apr.  1985


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  Abstract

Empirical force-field 방법을 중성자 회절 방법으로 분자구조가 밝혀진 D-sorbitol, CH2OH(CHOH)4CH2OH에 적용하여 비교 연구하였다. C-C결합 길이는 계산값과 실험값이 0.009Å 내에서 C-O 결합 길이는 0. 023Å내에서 일치하는 좋은 결과를 얻었다. C-C-C 와 C-C-O 결합 각도는 각각 2.3°와 1.9°이내에서 일치하였으나 crystal packing force의 영향을 많이 받고 있는 torsion angle은 상당한 차이가 있었다. C(1)-C(2)-C(3)-C(4) torsion angle을 규칙적으로 변화시키면서 steric 에너지를 연구한 결과 분자의 최저 에너지는 ψ=+90°부근에서 나타나 회절법에 의한 결정 구조와는 다른 결과를 얻었다. 그러나 C-O, O-H, O-lone-pair dipole들 간의 상호작용을 무시하면 ψ=-60°부근에서 최저에너지를 나타내어 결정구조와 일치 하였다. Empirical force-field 방법의 dipole 상호작용에 관한 에너지항을 개선하면 더 좋은 결과를 얻을 수 있을 것으로 예측 한다. Empirical force-field method has been applied to D-sorbitol, the crystal structure of which has been studied by the single crystal X-ray and neutron diffraction analyses. The calculated C-C bond lengths agree with those observed within 0.009Å. The C-O bond lengths show a larger deviation of 0. 023Å. The calculated C-C-C and C-C-O valence angles agree with those observed within 2.3° and 1.9°respectively. Because torsion angles are influenced by packing forces, they show considerably flarger r. m. s. deviations. Calculations of the conformational energies of the model compound at selected C(1)-C(2)-C(3)-C(4) torsion angles made with the program MMI, produced result that the prediction of the observed preferred conformation of the carbon chain appeares to be less satisfactory.

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  Cite this article

[IEEE Style]

Y. J. Park, "The Structure and Energy of D-Sorbitol from an Empirical force-Field," Journal of the Korean Chemical Society, vol. 29, no. 2, pp. 104-110, 1985. DOI: .

[ACM Style]

Young Ja Park. 1985. The Structure and Energy of D-Sorbitol from an Empirical force-Field. Journal of the Korean Chemical Society, 29, 2, (1985), 104-110. DOI: .

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